根据办理经验，日本公司设立周期一般为3至4周。其间，需要按具体流程来行事，包括以下内容。

材料确认：

确定公司名，选择成立株式会社还是合同会社。

确定公司地址，需要具体到都道府县市区町村。

确定公司注册资本金，最少为1日元，按需求来决定。

确定公司事业年度，例如每年12月末等。

确定公司的股东架构，包括董事（株式会社），业务执行员（合同会社）的人数。

材料准备：

印鉴证明，股东就任承诺书，公司印鉴申请书。

设立申请：

全部申请文件由专业的司法书士做成、在日本公证后，递交日本法务局进行登记。等待日本法务局登记，并取得株式会社/合同会社注册完成后的所有有效材料。

综上所述，所有步骤完成后，日本公司注册完成通常需要3至4周。